高通量原始数据下载、校验和保存指南

前言 不知道各位老师看过《高通量测序数据上传指南》没？实验设计的天衣无缝，数据分析的头头是道，投稿文章写的花团锦簇，But文章不被接收！   此刻的心情，无以言表。Why？审稿人要求提供数据登录号，What？数据登录号？这才醍醐灌顶，想到原始数据，那么问题来了，数据在哪？   翻箱倒柜CDEF盘找了个遍，还是没有，找合作公司再拷贝一遍？但合同中约定，自项目报告完成之日起，合作公司保留原始数据3个月……啊，到今天为止，一年过去了……   虽难以启齿，但碰碰运气呗，或许合作公司数据还在呢？若数据尚在，欧易定会再次提供给您，“硬数据，好服务”是欧易一贯的宗旨。不过万一数据逾期被删除了，也请您理解，我们已经使用了洪荒之力来查找了。汲取前车之鉴，今天小编就来跟大家聊聊数据下载、校验和保存的一些方法和注意事项。   Top1-数据下载 通常情况下，有两种数据释放方式：云释放和硬盘释放。 1.云释放 使用与欧易生物合作的华为云释放，华为云下载的方法如下： - 方法A：客户端下载 - [ 优点：可以批量下载；缺点：需要安装软件。（推荐使用客户端下载，虽需安装软件但更便捷）] 1.1下载OBS Browser 下载路径及方式： https://support.huaweicloud.com/clientogw-obs/zh-cn_topic_0045829056.html 根据电脑类型进行选择下载。   1.2登录OBS Browser并更新最新版本 1.2.1点击“获取共享”     1.2.2 输入“分享链接”和“提取码”并点击“确认”   1.2.3选中文件夹，点击“下载”   选择所要保存的位置即可。   1.2.4已完成中状态显示“成功”即完成下载     - 方法B：网页版下载 - [ 优点：直接网页版下载，不需要安装软件；缺点：文件只能一个一个下载 ] 将链接使用浏览器打开（推荐使用IE浏览器，其他浏览器可能会出错） 输入提取码，选择下载位置进行下载即可。   Tips： 1.分享链接和提取码不能有空格 2.注意链接有效期，请在有效期内下载 【P.S】OBS往本地下载，受宽带速度限制， ①如果老师您有云计算服务器，通过云平台直接从OBS下载，速度非常快，平均500Mb/s。 ②如果老师您有普通集群，通过集群从OBS下载，速度快，稳定。   2.硬盘释放 自备硬盘，无需云端下载，项目专员将数据下载至老师提供的硬盘后，以邮寄送返或人工送返的形式给到您。（注意事项：如需硬盘释放的老师需提前准备好硬盘，或在签订的合同中委托我们购买。）   Top2-数据校验 1.安装GIT-bash 与 notepad软件 GIT-bash 是运行脚本的软件，安装包为 Git-2.22.0-64-bit.exe Notepad 是查看MD5值的软件，安装包为 npp.7.7.1.Installer.exe     2.校验 根据我们提供的MD5值文件格式普遍如下，首列为MD5数值，第二列为文件的全名，两列的分隔符为tab分隔符，也有以空格作为分隔符   请将我们提供的MD5值文件命名为md5.txt 将脚本check_md5.sh与以gz结尾的文件放在同一文件夹下，该文件夹下不要有其他文件夹和文件 右键打开 Git-bash，然后运行脚本，代码如下sh check_md5.sh 会生成一个 check_result.txt 的文件，如果文件的md5值能够匹配，则会显示 MD5 is OK 如果文件的md5值不能够匹配，则会显示 MD5 is missing 。     若需要“数据md5值校验方法”压缩包，可在本文留言索取 数据校验无误后，不要忘记给我们的项目专员回复一个邮件哦~ 若数据校验有误，烦请第一时间联系项目专员，我们将竭力为您服务。   Top3-数据保存 校验完成后，确认下样本个数是否正确，然后就可以存档了。存在哪里呢？一般来说，大多数老师的数据不是很大，几十G，电脑存储即可，有些老师的数据喜欢保存在移动硬盘里，也是不错的选择，但是电脑和移动硬盘有一定的寿命，安全起见，建议客户两手准备，确保云上和线下各留一份。（如：注册一个百度云将相关数据备份至百度云上。）   END 本文系欧易生物原创 转载请注明本文转自欧易生物